II kaitsekategooria sõnajalgtaimed (Pteridophyta)

Müür-raunjalg

Asplenium ruta-muraria

Pruun raunjalg

Asplenium trichomanes

Vitsosi

Equisetum x moorei

Alssosi

Equisetum scirpoides

Järv-lahnarohi

Isoetes lacustris

Koldjas selaginel

Selaginella selaginoides

II kaitsekategooria paljasseemnetaim (Gymnospermae)

Harilik jugapuu

Taxus baccata

II kaitsekategooria katteseemnetaimed (Angiospermae)

Püramiid-akakapsas

Ajuga pyramidalis

Karvane maarjalepp

Agrimonia pilosa

Roomav akakapsas

Ajuga reptans

Väike konnarohi

Alisma gramineum

Nurmlauk

Allium vineale

Gmelini kilbirohi

Alyssum montanum subsp. Gmelinii

Püramiid-koerakäpp

Anacamptis pyramidalis

Emaputk

Angelica palustris

Salutakjas

Arctium nemorosum

Palu-liivkann

Arenaria procera

Meripuju

Artemisia maritima

Oja-haneputk

Berula erecta

Kiirjas ruse

Bidens radiata

Kummeli-võtmehein

Botrychium multifidum

Varju-püsikluste

Bromus benekenii

Peen jänesekõrv

Bupleurum tenuissimum

Turvastarn

Carex heleonastes

Sagristarn

Carex irrigua

Randtarn

Carex extensa

Klibutarn

Carex glareosa

Gallia tarn

Carex ligerica

Põhjatarn

Carex mackenziei

Jalgtarn

Carex rhizina

Nokktarn

Carex rhyncophysa

Õrn tarn

Carex disperma

Valge tolmpea

Cephalanthera longifolia

Punane tolmpea

Cephalanthera rubra

Madal kadakkaer

Cerastium pumilum

Uimastav varesputk

Chaerophyllum temulum

Laialehine nestik

Cinna latifolia

Pori-nõiakold

Circaea lutetiana

Taani merisalat

Cochlearia danica

Kõdu-koralljuur

Corallorhiza trifida

Vahelmine lõokannus

Corydalis intermedia

Pehme koeratubakas

Crepis mollis

Kevad-ristmadar

Cruciata glabra

Pruun lõikhein

Cyperus fuscus

Kaunis kuldking

Cypripedium calceolus

Täpiline sõrmkäpp

Dactylorhiza cruenta

Saaremaa sõrmkäpp

Dactylorhiza osiliensis

Russowi sõrmkäpp

Dactylorhiza russowii

Nõmmnelk

Dianthus arenarius

Aasnelk

Dianthus superbus

Sile tondipea

Dracocephalum ruyschiana

Mõru vesipipar

Elatine hydropiper

Rand-orashein

Elytrigia junceiformis

Sale villpea

Eriophorum gracile

Rand-ogaputk

Eryngium maritimum

Mets-aruhein

Festuca altissima

Sinine emajuur

Gentiana pneumonanthe

Kivi-kurereha

Geranium columbinum

Läikiv kurereha

Geranium lucidum

Niidu-kuremõõk

Gladiolus imbricatus

Kahar parthein

Glyceria lithuanica

Lõhnav käoraamat

Gymnadenia odoratissima

Hall soolmalts

Halimione pedunculata

Harilik luuderohi

Hedera helix

Harilik käokuld

Helichrysum arenarium

Harilik muguljuur

Herminium monorchis

Pehme mesihein

Holcus mollis

Loim-vesipaunikas

Hydrocotyle vulgaris

Mägi-naistepuna

Hypericum montanum

Võsu-liivsibul

Jovibarba sobolifera

Rabaluga

Juncus stygius

Tömbiõiene luga

Juncus subnodulosus

Sale haguhein

Koeleria gracilis

Must seahernes

Lathyrus niger

Jõgi-metsriis

Leersia oryzoides

Soohiilakas

Liparis loeselii

Väike käopõll

Listera cordata

Vesilobeelia

Lobelia dortmanna

Harilik sookold

Lycopodiella inundata

Ainulehine sookäpp

Malaxis monophyllos

Harilik sookäpp

Malaxis paludosa

Ida-võsalill

Moehringia lateriflora

Siberi piimikas

Mulgedium sibiricum

Vahelduvaõiene vesikuusk     

Myriophyllum alterniflorum

Vahelmine näkirohi

Najas marina subsp. Intermedia

Liiv-esparsett

Onobrychis arenaria

Kärbesõis

Ophrys insectifera

Jumalakäpp

Orchis mascula

Arukäpp

Orchis morio

Tõmmu käpp

Orchis ustulata

Karvane lipphernes

Oxytropis pilosa

Kuninga-kuuskjalg

Pedicularis sceptrum-carolinum

Alpi võipätakas

Pinguicula alpina

Austria roidputk

Pleurospermum austriacum

Alpi nurmikas

Poa alpina

Rand-kirburohi

Polygonum oxyspermum

Juus-penikeel

Potamogeton trichoides

Laukapuu

Prunus spinosa

Palu-karukell

Pulsatilla patens

Salutulikas

Ranunculus nemorosus

Saaremaa robirohi

Rhinanthus osiliensis

Tume nokkhein

Rhynchospora fusca

Mesimurakas

Rubus arcticus

Rand-kesakann

Sagina maritima

Hanepaju

Salix repens

Liht-randpung

Samolus valerandi

Eesti soojumikas

Saussurea alpina subsp. Esthonica

Kollane kivirik

Saxifraga hirculus

Mustjas sepsikas

Schoenus nigricans

Juurduv kõrkjas

Scirpus radicans

Palu-põisrohi

Silene chlorantha

Madal unilook

Sisymbrium supinum

Tuhkpihlakas

Sorbus rupicola

Lamedalehine jõgitakjas

Sparganium angustifolium

Ujuv jõgitakjas

Sparganium gramineum

Lääne-sõlmhein

Spergularia media

Rand-soodahein

Suaeda maritima

Püst-linalehik

Thesium ebracteatum

Lamav ristik

Trifolium campestre

Siberi koldkaer

Trisetum sibiricum

Nõmm-mailane

Veronica dillenii

Väikeseõieline hiirehernes

Vicia lathyroides

Peenelehine hiirehernes

Vicia tenuifolia

Kõrge kannike

Viola elatior

Pisikannike

Viola pumila

Laanekannike

Viola selkirkii

II kaitsekategooria sammaltaimed (Bryota)

Kurruline tuhmik

Anomodon rugelii

Õunjas bartraamia

Bartramia pomiformis

Kolmehõlmaline batsaania

Bazzania trilobata

Turd-lühikupar

Brachythecium turgidum

Meri-pungsammal

Bryum marratii

Vesi-tömptipp

Calliergon megalophyllum

Mustpeasammal

Catoscopium nigritum

Juus-kiilsirbik

Dichelyma capillaceum

Vesi-kiilsirbik

Dichelyma falcatum

Roheline kaksikhammas

Dicranum viride

Könttanukas

Encalypta mutica

Tamarisk-kariksammal

Frullania tamarisci

Perssoni lõhiksammal

Lophozia perssonii

Kurdõhik

Neckera crispa

Allika-vesitiivik

Octodiceras fontanum

Põhja-roodik

Palustriella decipiens

Oederi põikkupar

Plagiopus oederi

Lainjas põikkupar

Plagiothecium undulatum

Sale katiksammal

Pterogonium gracile

Kurdsammal

Rhytidium rugosum

Sinisammal

Saelania glaucescens

Meklenburgi timmia

Timmia megapolitana

Jäik keerdsammal

Tortella rigens

Suur sagarsammal

Tritomaria quinquedentata

Tundra vesisirbik

Warnstorfia tundrae

II kaitsekategooria seened (Fungi)

Sireli-lambaseenik

Albatrellus syringae

Lepa-kärbseseen

Amanita friabilis

Lehise-õõspuravik

Boletinus cavipes

Must hundiseenik

Boletopsis leucomelaena

Punajalg-kivipuravik

Boletus erythropus

Fechtneri kivipuravik

Boletus fechtneri

Mõru kivipuravik

Boletus radicans

Kollane kivipuravik

Boletus suspectus

Soo-maamuna

Bovista paludosa

Lilla kukeseen

Cantharellus melanoxeros

Säärissirmik

Chamaemyces fracidus

Bloxami punalehik

Entoloma bloxamii

Liiv-maakeel

Geoglossum arenarium

Purpur-maakeel

Geoglossum atropurpureum

Ebe-limanutt

Hygrophorus chrysodon

Tammepässik

Inonotus dryophilus

Kuldpiimane riisikas

Lactarius chrysorrheus

Roosa riisikas

Lactarius controversus

Ripsriisikas

Lactarius mairei

Värviline lehtervahelik

Leucopaxillus compactus

Valge sirmik

Macrolepiota nympharum

Kellukmürkel

Morchella semilibera

Luiteliudik

Peziza ammophila

Mugultorik

Polyporus tuberaster

Kroonliudik

Sarcosphaera coronaria

Kährikseen

Sparassis crispa

Sellerheinik

Tricholoma apium

II kaitsekategooria samblikud (Lichens)

Harilik tuustsamblik

Alectoria sarmentosa

Nõel-narmassamblik

Bryoria furcellata

Tera-mõhnsamblik

Bacidia biatorina

Kirss-mõhnsamblik

Bacidia laurocerasi

Kahvatu seensamblik

Baeomyces carneus

Rohe-tilksamblik

Biatoridium monasteriense

Näsa-kuldsamblik

Caloplaca verruculifera

Oliiv-helksamblik

Cetrelia olivetorum

Härma-varjusamblik

Chaenotheca cinerea

Vask-porosamblik

Cladonia convoluta

Sire-säärsamblik

Cybebe gracilenta

Must limasamblik

Collema nigrescens

Kollane virvesamblik

Dimerella lutea

Harilik kitsesamblik

Flavoparmelia caperata

Jalaka-kauss-samblik

Gyalecta ulmi

Männi-soomussamblik

Hypocenomyce anthracophila

Sõrmjas tardsamblik

Leptogium teretiusculum

Karvane kruupsamblik

Micarea hedlundii

Kääv-neersamblik

Nephroma resupinatum

Külm purusamblik

Ochrolechia frigida

Väike nõgisamblik

Parmeliella triptophylla

Serva-kilpsamblik

Peltigera collina

Hõbe-luulissamblik

Pyrenula laevigata

Õli-luulissamblik

Pyrenula nitidella

Ruske nuisamblik

Sclerophora coniophaea

Sale nuisamblik

Sclerophora farinacea

Võrk-nuisamblik

Sclerophora peronella

Harilik lohksamblik

Solorina saccata

Käsnjas lohksamblik

Solorina spongiosa

Valge vahasamblik

Squamarina lentigera

Loo-rebasesamblik

Vulpicida tubulosus

Mougeot’ koldsamblik

Xanthoparmelia mougeotii

II kaitsekategooria selgrootud loomad (Invertebrata)

Apteegikaan

Hirudo medicinalis

Paksukojaline jõekarp

Unio crassus

Eremiitpõrnikas

Osmoderma eremita

Väike-punalamesklane

Cucujus cinnaberinus

Männisinelane

Boros schneideri

Mustlaik-apollo

Parnassius mnemosyne

II kaitsekategooria selgroogsed loomad (Vertebrata)

Säga

Silurus glanis

Tõugjas

Aspius aspius

Harivesilik

Triturus cristatus

Mudakonn

Pelobates fuscus

Kivisisalik

Lacerta agilis

Järvekaur

Gavia arctica

Sarvikpütt

Podiceps auritus

Hüüp

Botaurus stellaris

Väikeluik

Cygnus columbianus

Laululuik

Cygnus cygnus

Soopart

Anas acuta (haudeasurkond)

Merivart

Aythya marila (haudeasurkond)

Kirjuhahk

Polysticta stelleri

Väikekoskel

Mergus albellus

Kanakull

Accipiter gentilis

Metsis

Tetrao urogallus

Väikehuik

Porzana parva

Naaskelnokk

Recurvirostra avosetta

Mudanepp

Lymnocryptes minimus

Rohunepp

Gallinago media

Mustsaba-vigle

Limosa limosa

Kivirullija

Arenaria interpres

Väikekajakas

Larus minutus

Tõmmukajakas

Larus fuscus

Räusktiir

Sterna caspia

Tutt-tiir

Sterna sandvicensis

Alk

Alca torda

Krüüsel

Cepphus grylle

Sooräts

Asio flammeus

Karvasjalg-kakk

Aegolius funereus

Jäälind

Alcedo atthis

Roherähn

Picus viridis

Valgeselg-kirjurähn

Dendrocopos leucotos

Laanerähn

Picoides tridactylus

Nõmmekiur

Anthus campestris

Randkiur

Anthus petrosus

Luha-sinirind

Luscinia svecica cyanecula

Põldtsiitsitaja

Emberiza hortulana

Veelendlane

Myotis daubentonii

Tiigilendlane

Myotis dasycneme

Tõmmulendlane

Myotis brandtii

Habelendlane

Myotis mystacinus

Nattereri lendlane

Myotis nattereri

Suurkõrv

Plecotus auritus

Suurvidevlane

Nyctalus noctula

Kääbus-nahkhiir

Pipistrellus pipistrellus

Pargi-nahkhiir

Pipistrellus nathusii

Pügmee-nahkhiir

Pipistrellus pygmaeus

Suur-nahkhiir

Vespertilio murinus

Põhja-nahkhiir

Eptesicus nilssonii

Viigerhüljes

Phoca hispida